El directorio de FORAGUA esta constituido por 5 miembros por periodos de hasta 2 años. La presidencia del fideicomiso es rotativa entre las tres provincias y es asumida por el mayor aportante entre los alcaldes de los municipios exclusivamente hasta por 3 años. El directorio para el año 2016-2018 esta conformado por los siguientes miembros mas el Secretario Técnico que es elegido por periodos de dos años:

El directorio se reúne cada 3 meses y la Junta una ves al año, pudiendo convocar reuniones extraordinarios el presidente del directorio.

El Fondo Regional del Agua – FORAGUA está estructurado en fusión de estipulado en el contrato de fideicomiso de la siguiente manera: